选择MBR还是GUID分区方式对于X99主板来说，主要取决于你的具体需求和使用的操作系统。
MBR（Master Boot Record）是传统的分区方式，它适用于Windows 7及以下版本的操作系统。它的优点在于兼容性较好，可以支持各种操作系统和硬件设备。然而，MBR对分区容量有限制，最大支持的分区容量为2TB，且最多只能支持4个主分区。这意味着如果你的硬盘容量超过2TB，或者你需要创建更多的分区，MBR可能无法满足你的需求。
相比之下，GUID（Globally Unique Identifier）是一种较新的分区方式，它主要用于Windows 8及更高版本的操作系统。GUID分区表可以支持更多的分区，并且理论上没有容量限制，最大可以达到18EB。这使得GUID分区方式成为处理大型存储和高级服务器系统的首选。此外，GUID分区方式还提供了更好的兼容性和灵活性，可以同时支持不同操作系统和多重引导。在安全性方面，GUID分区方式自带备份，当磁盘出现损坏时，它还能通过备份启动，而MBR则可能直接无法启动。
因此，如果你的X99主板主要用于运行Windows 8或更高版本的操作系统，且你的硬盘容量较大或需要创建多个分区，那么GUID分区方式可能更适合你。反之，如果你主要使用Windows 7或更早版本的操作系统，且硬盘容量不超过2TB，那么MBR分区方式可能更合适。
总的来说，选择MBR还是GUID取决于你的具体需求和使用的操作系统。在做出选择时，请务必考虑你的硬盘容量、分区需求以及操作系统的兼容性。
1. 首先，x99主板通常采用pcie 3.0插槽，而gtx 4060显卡使用的是pcie 4.0接口。虽然pcie是向下兼容的，但是pcie 3.0插槽无法完全发挥pcie 4.0显卡的性能。
2. 其次，x99主板与gtx 4060显卡的兼容性也受到bios版本的限制。旧版本的bios可能无法正确识别或驱动最新的显卡，导致无法正常工作。
3. 最后，即使x99主板能够物理上插入gtx 4060显卡，也不能保证能够在最佳性能下正常工作。建议在购买前确认主板bios是否支持最新的显卡，并考虑升级至支持pcie 4.0的主板以获取更好的性能和兼容性。
一般来说，X99主板搭配2690v3这样的高性能处理器可以提供很好的游戏性能。然而，游戏卡顿取决于许多因素，包括游戏本身的优化、显卡性能、内存和存储选择等等。因此，并不能保证完全没有游戏卡顿现象，但使用X99主板搭配2690v3处理器在一定程度上可以提高游戏体验。建议配合高性能显卡、快速内存和SSD硬盘等组合以获得更好的游戏性能。